Le cursus des sections bilingues dure six ans jusqu’à la maturita bilingue.
Pendant les deux premières années, les élèves apprennent le français à raison de 10 heures hebdomadaire. La langue d’enseignement dans les autres disciplines est la langue tchèque.
De la troisième à la sixième année, les élèves reçoivent un enseignement renforcé de la langue et littérature françaises et un enseignement des disciplines non linguistiques (DNL) en français : mathématiques, physique, chimie, histoire, géographie.
Les sections bilingues franco-tchèques ne proposent pas de formation purement linguistique, mais une formation à dominante scientifique, doublée d’un excellent niveau en langue française, tant à l’écrit qu’à l’oral. L’originalité de cette formation réside dans une double approche pédagogique, « une tradition tchèque » privilégiant les apprentissages encyclopédiques et une « approche française » développant les stratégies d’argumentation. On peut aussi qualifier cet enseignement de « biculturel ».